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 酶制劑。主要用于啤酒抗寒(水解啤酒中的蛋白質，避免冷藏后引起的渾濁)、肉類軟化(水解肌肉蛋白和膠原蛋白，使肉類嫩化)、谷類預煮的準備、水解蛋白質的生產。在啤酒抗寒和肉類軟化方面的應用，遠比其他蛋白酶Chemicalbook類廣泛。用量一般為1～4mg/kg。用途木瓜蛋白酶廣泛用于肉類嫩化，也可作為啤酒的澄清劑使用。我國規定可用于餅干、肉禽制品水解和動、植物蛋白，按生產需要適量使用。用途用于醫藥、食品工業及化妝品添加劑

木瓜蛋白酶是一種含疏基(-SH)肽鏈內切酶，具有蛋白酶和酯酶的活性，有較廣泛的特異性，對動植物蛋白、多肽、酯、酰胺等有較強的水解能力，同時，還具有合成功能，能把蛋白水解物合成為類蛋白質。溶于水和甘油，水溶液無色或淡黃色，有時呈乳白色；幾乎不溶于乙醇、Chemicalbook氯仿和乙醚等有機溶劑。PH值5.7(一般3～9.5皆可)，在中性或偏酸性時亦有作用，等電點18.75；溫度55～60℃(一般10～85℃皆可)，耐熱性強，在90℃時也不會完全失活；受氧化劑抑制，還原性物質激活。未經澄清就干燥的酶即為粗制酶。